Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znhit3Q9CQK1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znhit3Q9CQK1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znhit3Q9CQK1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms