Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tsnaxip1Q99P25 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms