Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcf2Q99LE6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms