Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt16hQ920B9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Supt16hQ920B9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Supt16hQ920B9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms