Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc44a4Q91VA1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc44a4Q91VA1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a4Q91VA1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms