Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp4Q8VHC5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp4Q8VHC5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms