Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Smg8Q8VE18 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Smg8Q8VE18 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Smg8Q8VE18 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Smg8Q8VE18 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smg8Q8VE18 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Smg8Q8VE18 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Smg8Q8VE18 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Smg8Q8VE18 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Smg8Q8VE18 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Smg8Q8VE18 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smg8Q8VE18 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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