Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snapc4Q8BP86 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snapc4Q8BP86 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms