Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med16Q6PGF3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med16Q6PGF3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms