Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm29Q6PDI5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms