Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smchd1Q6P5D8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smchd1Q6P5D8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms