Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn11Q6J756 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn11Q6J756 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn11Q6J756 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms