Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms