Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim25Q61510 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim25Q61510 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim25Q61510 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim25Q61510 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim25Q61510 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim25Q61510 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim25Q61510 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim25Q61510 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim25Q61510 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim25Q61510 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim25Q61510 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim25Q61510 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim25Q61510 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim25Q61510 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim25Q61510 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim25Q61510 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms