Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm1Q60636 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms