Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmtc2Q56A06 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms