Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam228bQ497Q6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228bQ497Q6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms