Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf6Q3TWW8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms