Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f1Q3THK3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2f1Q3THK3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.9 ms