Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim63Q38HM4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim63Q38HM4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms