Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sdr16c6Q05A13 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms