Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r236Q05A06 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms