Protein–RNA interactions for Protein: Q01755

Tcp11, T-complex protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11Q01755 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcp11Q01755 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms