Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux2P70298 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cux2P70298 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux2P70298 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cux2P70298 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cux2P70298 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cux2P70298 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cux2P70298 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cux2P70298 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux2P70298 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux2P70298 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux2P70298 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux2P70298 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cux2P70298 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms