Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps11P62281 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps11P62281 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps11P62281 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps11P62281 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1060.3 ms