Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnga1P29974 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms