Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmi1P25916 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms