Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsaP16675 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsaP16675 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsaP16675 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsaP16675 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms