Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosP01101 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosP01101 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosP01101 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosP01101 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosP01101 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosP01101 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FosP01101 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosP01101 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FosP01101 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosP01101 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosP01101 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosP01101 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosP01101 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosP01101 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosP01101 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosP01101 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FosP01101 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FosP01101 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FosP01101 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FosP01101 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FosP01101 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FosP01101 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FosP01101 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FosP01101 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FosP01101 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FosP01101 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FosP01101 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FosP01101 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FosP01101 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FosP01101 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FosP01101 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FosP01101 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FosP01101 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FosP01101 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FosP01101 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FosP01101 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FosP01101 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FosP01101 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FosP01101 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FosP01101 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FosP01101 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FosP01101 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FosP01101 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FosP01101 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FosP01101 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FosP01101 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FosP01101 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FosP01101 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.9 ms