Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc4a4O88343 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms