Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabep1O35551 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabep1O35551 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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