Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad7O35253 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad7O35253 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad7O35253 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad7O35253 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad7O35253 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad7O35253 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad7O35253 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad7O35253 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad7O35253 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad7O35253 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad7O35253 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad7O35253 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms