Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CckarO08786 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CckarO08786 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CckarO08786 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CckarO08786 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CckarO08786 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CckarO08786 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CckarO08786 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckarO08786 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckarO08786 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckarO08786 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckarO08786 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckarO08786 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckarO08786 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckarO08786 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckarO08786 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckarO08786 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CckarO08786 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckarO08786 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckarO08786 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckarO08786 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckarO08786 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckarO08786 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms