Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna4O08542 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna4O08542 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna4O08542 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna4O08542 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna4O08542 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms