Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4aF8VPX6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms