Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx7F8VPJ6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rfx7F8VPJ6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rfx7F8VPJ6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms