Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17175E9Q528 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17175E9Q528 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms