Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apba1B2RUJ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apba1B2RUJ5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms