Protein–RNA interactions for Protein: B1B212

H60b, Histocompatibility antigen 60b, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60bB1B212 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H60bB1B212 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H60bB1B212 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60bB1B212 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60bB1B212 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60bB1B212 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H60bB1B212 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H60bB1B212 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60bB1B212 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms