Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Svep1A2AVA0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Svep1A2AVA0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms