Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.3 ms