Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited4Q9WUL8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms