Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trpv2Q9WTR1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trpv2Q9WTR1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms