Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd164Q9R0L9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cd164Q9R0L9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms