Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Efhd1Q9D4J1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Efhd1Q9D4J1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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Efhd1Q9D4J1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Efhd1Q9D4J1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Efhd1Q9D4J1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhd1Q9D4J1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhd1Q9D4J1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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