Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan11Q9D1D1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan11Q9D1D1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms