Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0K0

Tbc1d7, TBC1 domain family member 7, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d7Q9D0K0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d7Q9D0K0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d7Q9D0K0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d7Q9D0K0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms