Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Lrrc17Q9CXD9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc17Q9CXD9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc17Q9CXD9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc17Q9CXD9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Lrrc17Q9CXD9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Lrrc17Q9CXD9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Lrrc17Q9CXD9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Lrrc17Q9CXD9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Lrrc17Q9CXD9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Lrrc17Q9CXD9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Lrrc17Q9CXD9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc17Q9CXD9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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