Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx28Q9CWT6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms