Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mid1ip1Q9CQ20 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mid1ip1Q9CQ20 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms